Drewniany kościół św. Bartłomieja Apostoła w Wójtowej pochodzi z XVI w. i wielokrotnie był przebudowywany. Jest późnogotycki, orientowany, jednonawowy, o konstrukcji zrębowej. Dachy są kalenicowe, ściany oszalowane pionowo. Od południa dostawiono w 1934 r. partie murowane: kaplicę i zakrystię. Wewnątrz znajduje się m.in barokowy ołtarz główny z około 1670 r, dwa późnobarokowe ołtarze boczne z 1760 r. i późnobarokowa drewniana chrzcielnica z około 1760 r. Kościół z Wójtowej nie leży na Szlaku Architektury Drewnianej w Małopolsce.